OpenBIS vs eLabFTW vs NOMAD Oasis vs. Chemotion
openBis
Vorteile
- Hierarchien und Verknüpfungen/Verbindungen (Proben-Experimente, ...) untereinander über parents-children-relationships gut (grafisch) darstellbar
- eigene Objekte mit starren Vorgaben können angelegt werden (z.B. Felder, wo man die Temperatur eingibt usw.)
- Integration von JupyterNotebooks
- plate wells möglich über openBis for screening
- Dynamic Properties
- LIMS
- für Multi-user (Multi-group) Systeme: individuelle Anpassung schwierig, da es nur auf Instanz-Ebene geht, d.h. angelegte Objekte sind für alle sichtbar => schwierig, weil es dann schnell unübersichtlich wird weil z.B. im drop-down-Menü zu viele Einträge sind
- Suchfunktion, mit der auch Parameter in bestimmten Bereich gesucht werden kann
Nachteile
- nur Englisch
- kein drawing-tool
- man ist an starre Strukturen gebunden
- keine vernünftige Möglichkeit, key-value pairs zu speichern (geht nur über spreadsheet => unschön)
- Export von Daten/Experimenten/... geht, aber (derzeit) kein Import (angebl. geplant)
eLabFTW
"white paper"
Möglichkeit der starren Vorgabe fehlt
Vorteile
- mehrere Sprachen frei wählbar
- JSON Editor (kann erstmal jeder editieren!)
- primitives drawing-tool vorhanden
- timestamping-Möglichkeit
- Todoliste
- Kalender, um z.B. Equipment zu buchen
- rel. aktive Community => z.B. viele Skripte verfügbar
- Experimente mit einzelnen Steps & Checkboxes wenn erledigt
- Kommentarfunktion
- Tags: extrem flexibel
- kann Daten aus Experimenten, ... exportieren (.eln, .zip) und wieder importieren; hilfreich auch für Kooperation von unterschiedlichen Arbeitsgruppen, z.T. auch universitätsübergreifend (z.B. Probe wird hergestellt, dann weitergeschickt => ELN Eintrag zur Probenherstellung exportieren, dann kann die nächste Arbeitsgruppe den Eintrag importieren und so genau nachvollziehen, was mit der Probe gemacht wurde)
ABER: beim Re-Import gehen z.B. Verknüpfungen zu "Database-Items" verloren, dh. z.B. Verknüpfungen zu Proben, Instruments, ...
beim Import von .zip Archiven werden auch angehängte Dateien nicht importiert (obwohl sie exportiert werden!) - Templates können als .tpl exportiert und wieder importiert werden
ABER: ich kann die Templates zwar importieren (auch als user über "User Control Panel" (nicht über Templates!), dann Templates; alternativ auch über "Manage templates"; dann: import from file), dabei geht aber alles verloren was im JSON stand, dh. auch extra fields sind weg => irgendwie Quatsch; auch die steps sind weg - für Multi-user (multi-group) systeme: eigentlich alle nötigen Anpassungen auf Team-Ebene, System-Admins werden nur für anlegen neuer Teams u.ä. benötigt
Nachteile
- Anbindung externer Geräte / Speicher? => über APIs möglich(?)
- keine plate wells möglich
- keine Jupyter-Notebooks (angebl. soll JupyterLite integriert werden)
- keine grafische Darstellung von Verbindungen bzw. Beziehungen z.B. zwischen Proben & Experimenten (parents-children, ...)
Chemotion
- starker Fokus auf Chemie
- Integration von (chemie-spezifischen) Ontologien
- Export- und Importfunktion
- Barcodes & QR Codes
NOMAD Oasis
- "structure-first" ELN
- Dateien basiert, echte Ordnerstruktur bleibt erhalten
- noch relativ neu, basiert auf dem NOMAD Repository
- integrierte Werkzeuge, wie z.B. JupyterHub
- (optional) Datenveröffentlichung über ein zentrales NOMAD
- RFC3161 time stamping
- keine grafische Darstellung von Verbindungen bzw. Beziehungen z.B. zwischen Proben & Experimenten (parents-children, ...)
Vorteile
Nachteile
Edited by Doris Matschkal